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      安捷倫SureSelect靶向序列捕獲
      安捷倫SureSelect靶向序列捕獲
      英文名稱:sure target enrichment system總訪問:11596
      國產/進口:進口半年訪問:362
      產地/品牌:安捷倫/Agilent產品類別:DNA測序/基因分析儀
      型       號:解決高通量測序的費用瓶頸問題 最后更新:2019-10-1
      貨       號:
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      銷售商: 安捷倫科技公司上海分公司 查看該公司所有產品 >>
      • 產品介紹
      • 公司簡介

      安捷倫SureSelect靶向序列捕獲系統 

      最新推出“人全外顯子捕獲”試劑盒!全面支持Solexa和SOLiD測序平臺!解決研究中的費用瓶頸問題,發揮高通量測序的全部力量
       
       
      Nature Biotech封面文章:液相序列捕獲技術與高通量測序
       

      安捷倫的SureSelect靶向序列捕獲系統可以顯著降低下一代測序技術(next-generation sequencing)的成本,并且可以極大程度的提高測序效率。SureSelect是一套基于安捷倫卓越的寡核苷酸合成技術的液相靶向序列捕獲系統,是一個適用于任何規模測序研究項目的可縮放平臺。完全不同于以往其它的序列捕獲方法,SureSelect系統僅僅需要3 µg的基因組DNA,這意味著研究者即使對珍貴樣本也可以進行高通量的平行靶向測序!

      如圖1所示,SureSelect液相靶向序列捕獲系統操作流程非常簡單,絕大多數步驟都在微型離心管或者微孔板中進行,目前已經可以和Illumina公司的基因組測序儀完美聯用。與其它下一代測序技術的主流廠商(Life Technologies and Roche)產品聯用的實驗方法,很快也將正式推出。依托于安捷倫杰出的免費在線設計平臺eArray(http://earray.chem.agilent.com/eArray), 客戶可以靈活定制最適合自身需求的序列捕獲系統。每套序列捕獲系統可以包含高達55,000條生物素標記的RNA“誘餌”寡核苷酸序列。
       
      http://opengenomics.com/images/Sure_Select_Fig1.png

        1. SureSelect 靶向序列捕獲系統操作流程
      借助eArray完成定制的序列捕獲系統,可能包含完全不同的RNA “誘餌”寡核苷酸序列,它們的表現又會怎樣?為了回答這個問題,安捷倫進行了大量的研究驗證工作。針對同一樣本的不同基因組序列區域,我們設計了多種不同的序列捕獲方案,進行多組平行對照實驗,利用測序結果中靶向序列讀出的比率作為富集效率的評判指標。如圖2所示,8種不同的定制序列捕獲方案所獲得的靶向序列讀出的比率在40-80%之間,意味著300-7400倍的富集效率,充分驗證了SureSelect系統的優異表現。

      http://opengenomics.com/images/Sure_Select_Fig2.png

       2. SureSelect靶向序列捕獲系統與定制設計策略
      不管序列捕獲設計方法的特異性如何優異,因為研究人員對基因組DNA進行隨機剪切,所以對靶向序列相鄰區域的捕獲仍然不能完全避免。但是,如圖2所示,安捷倫的SureSelect系統擁有極佳的序列捕獲特異性,對離開靶向序列區域200 bp以外的序列幾乎沒有捕獲。

      衡量DNA測序技術的另外一個重要指標是測序數據的覆蓋深度。較高的覆蓋深度,往往也意味著更好的辨識序列多態性的能力。圖3的測序結果表明,超過80%的序列都可以獲得20x以上的覆蓋深度,因此完全可以輕松完成利用重新測序方法對基因組特定區域中SNP的辨識。
       
      http://opengenomics.com/images/Sure_Select_Fig3.png

      圖 3. SureSelect 靶向序列捕獲系統的覆蓋深度

      產品信息

       

      SureSelect液相系統

      SureSelect固相系統

      研究

      10-1,000樣本

      1-10 樣本

      DNA起始量

      1-3 µg

      1-20 µg*

      可捕捉的序列長度 (定制試劑盒。不收設計費)

      6。6+ Mb

      1+ Mb

       
      最新推出“人全外顯子捕獲”試劑盒!全外顯子序列(權威CCDS數據庫)和>1,000非編碼RNA,一次試驗,一網打盡!

        
      更多詳情,請訪問www.opengenomics.com

       

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